由于真空冷冻干燥菌种不需要特殊的保存和寄送条件，并且可以随时提供，因此，CGMCC提供的大部分菌种均是中心自行批量制备的真空冷冻干燥菌种。部分保藏菌种不能利用冷冻干燥方法保存，只能采用冻结方法保存，甚至必须保持其处于存活状态。当订购这类菌种时，通常需要2-3周的准备时间，一些生长缓慢的菌种甚至需要更长的准备时间。